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硫代硫酸根离子的分子式为S₂O₃²⁻，是一种重要的含硫阴离子。其结构特点是中心硫原子与三个氧原子形成四面体结构，另一个硫原子与中心硫原子相连，整体带2个负电荷。硫代硫酸根离子为无色离子，易溶于水，在溶液中相对稳定，具有强还原性，这些特性使其在化学分析和工业应用中具有重要价值。
亚硫酸根离子的分子式为SO₃²⁻，是另一种重要的含硫阴离子。其结构特点是中心硫原子与三个氧原子成键，形成三角锥形结构，键角约为106度，整体带2个负电荷。与硫代硫酸根相比，亚硫酸根的原子数更少，结构更简单，对称性更高。这种结构差异直接影响了两种离子的化学性质和反应活性。
硫代硫酸根离子具有强还原性和络合性，是定量分析中的重要试剂。其还原性主要体现在与碘的反应中，两个硫代硫酸根离子与一个碘分子反应生成四硫酸根离子和碘离子。此外，硫代硫酸根还能与银离子形成络合物，这是其在摄影定影中的应用原理。在碘量法滴定中，硫代硫酸钠常用作标准溶液，利用其与碘的定量反应来测定氧化性物质的含量。
亚硫酸根离子具有还原性和弱碱性，在不同条件下表现出不同的反应活性。在酸性条件下，亚硫酸根能被高锰酸钾、双氧水等强氧化剂氧化生成硫酸根离子。亚硫酸根还能发生歧化反应，在酸性条件下分解生成二氧化硫和硫酸根离子。此外，亚硫酸根离子还具有弱碱性，能与水反应生成氢氧根离子。在碱性条件下，亚硫酸根相对稳定，而在酸性条件下则容易发生各种反应。
硫代硫酸根和亚硫酸根在不同条件下表现出不同的稳定性特征。硫代硫酸根在中性和碱性条件下相对稳定，但在酸性条件下容易分解，生成单质硫、二氧化硫和水。加热也会促进其分解。相比之下，亚硫酸根的稳定性更好，虽然在酸性条件下会发生歧化反应，但在碱性条件下较为稳定。总体而言，亚硫酸根的稳定性优于硫代硫酸根，酸性条件对两种离子的稳定性影响都很大，温度升高对两者都不利。