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魏晋南北朝时期从公元220年到589年，历时近370年，是中国历史上的大分裂时代。这一时期以黄河、长江和秦岭淮河线为重要地理分界，形成了从三国鼎立到西晋短暂统一，再到东晋十六国混战，最后南北朝长期对峙的复杂政治格局。地理环境的分割为政治分裂提供了天然条件。
三国时期，曹魏政权面临复杂的胡汉关系问题。匈奴、鲜卑、羯、氐、羌等五胡民族大规模内迁，为中原地区带来新的人口构成。西晋统一后，司马氏试图通过分封制处理民族问题，但效果有限。八王之乱的爆发严重削弱了西晋政权，为五胡乱华埋下了祸根，民族矛盾日益尖锐。
五胡十六国时期，匈奴、鲜卑、羯、氐、羌等民族在北方建立了众多政权。前秦苻坚实行民族融合政策，一度统一北方，但在淝水之战中败给东晋后，北方再次陷入分裂。这一时期出现了石勒的胡汉分治和苻坚的民族融合等不同治理模式，民族冲突与融合并存，为后来的民族大融合奠定了基础。
南北朝时期形成了长期对峙的政治格局。南朝包括宋齐梁陈四个汉族政权，定都建康；北朝则有北魏及其分裂后的东西魏、北齐北周等政权。北魏孝文帝实行全面汉化改革，迁都洛阳，推行均田制，促进了民族融合。南朝则接纳大量北方流民，南北之间虽有军事对抗，但文化交流从未中断。
魏晋南北朝时期的民族融合呈现深化趋势。通过通婚、文化交流、制度融合和语言变化等多种方式，各民族实现了深度融合。鲜卑族的汉化和汉族的胡化形成双向文化交流，创造了新的文化形态。这一时期的民族融合为隋唐大一统奠定了坚实基础，对中华民族的形成具有深远的历史意义。