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化石证据是支持人类进化的关键。从700万年前的乍得沙赫人到300万年前的南方古猿露西，再到能人、直立人，最后到30万年前的智人，化石记录展示了人类演化的连续过程。
基因证据显示，人类与黑猩猩的DNA序列相似度高达98.8%，与大猩猩相似度98.4%，与猩猩相似度97%。这种高度的基因相似性表明我们共享一个相对较近的共同祖先，为人类自然进化提供了分子生物学证据。
比较解剖学显示，人类与黑猩猩等灵长类动物具有相似的身体结构。如上肢骨骼结构、脊柱弯曲方式等，这些同源结构表明我们来自共同的祖先，只是在不同环境中进化出了不同功能。
胚胎学研究发现，人类、鱼类、鸟类等脊椎动物在胚胎发育早期表现出惊人的相似性，如都有鳃裂和尾巴。这些共同特征随着发育逐渐分化，表明它们有共同的祖先，为进化论提供了有力证据。